曲煥章在行醫過程注重探索各種草藥配制之后的變化與用途，勇于創新。他既注意學習和繼承中國的傳統醫學知識，又重視博采眾長，遍嘗上百種草藥，經過多年的的反復試制、改進和驗證，于1902年創制出對治療跌打損傷、內臟出血有奇特功效的云南白藥（百寶丹）。
1933年，“曲煥章大藥房”于昆明金碧路建造落成，開始規模化生產和銷售曲煥章萬應百寶丹。藥房落成各界名流均送匾題詞。云南省主席龍云贈“針膏起疾”匾，國民黨元老胡漢明贈“白藥如神”匾。
1938年，云南58、60軍北上抗日，曲煥章滿腔愛國熱血沸騰難抑，主動捐獻3萬瓶萬應百寶丹給抗日官兵。3月，李宗仁親率川、滇、魯諸軍，在臺兒莊與日軍浴血奮戰，一舉斃敵兩萬余人。白藥因藥效如神，作為滇軍的“隨身三件寶”之一，滇軍神威也令白藥名聲大振，為抗日戰爭做出了卓越的貢獻。在抗日戰爭時期，白藥供不應求，在國內暢銷，并遠銷港澳、新加坡、雅加達、馬來西亞、泰國等地，
1955年10月，繆蘭瑛由衷的感謝共產黨和政府的關懷和照顧，并為了使百寶丹有更大的發展，更好的為人民服務，繆蘭瑛將“曲煥章萬應百寶丹”處方和技術全部貢獻給國家。10月，經昆明市人民政府衛生局批準，將原曲煥章大藥房庫存藥品、藥材、物資等作價收買劃歸國營昆明市制藥廠，“曲煥章萬應百寶丹”改名為“云南白藥”，由地方國營昆明市制藥廠正式生產，確定了白藥生產的工藝和質量標準，任命繆蘭瑛為技師，負責白藥生產的技術指導，并動工興建白藥車間。
1956年1月23日昆明市制藥廠申請生產“云南白藥”，經昆明市衛生局（56）醫字159號批準，1956年2月昆明市制藥廠五車間開始正式生產云南白藥。
1970年6月，周恩來總理對云南白藥的生產情況相當關心，并做了三條重要指示：一、建立一個生產云南白藥的專廠；二、對云南白藥建立專門的研究機構；三、建立云南白藥原料的生產基地。
1971年5月20日，云南省燃料化學工業局革命委員會（71）云燃化革政字第29號文批準成立云南白藥廠革命委員會。
1993年5月云南省體制改革委員會云體改[1993]48號文同意成立云南白藥實業股份有限公司，11月6日—9日“云白藥”順利發行，同期“云白藥”在深圳證券交易所掛牌上市，成為云南省第一家上市公司。
1996年11月云南省經濟體制改革委員會云體改復[1996]48號文同意組建云南白藥集團股份有限公司，以現金形式出資，對大理制藥廠、文山州制藥廠、麗江藥業有限公司三家企業進行控股，實行母子公司管理體制的企業法人聯合體，實現了云南白藥的“五統一”（統一生產計劃、統一商標、統一批準文號、統一質量管理、統一銷售），實現了云南白藥的獨家生產經營。
1999年12月云南白藥集團出資3000萬元組建云南白藥集團醫藥電子商務有限公司，標志著營銷工作的創新改造開始啟動，
2011年10月，云南白藥從生產了40年的昆明51號正式轉場至呈貢區，整體搬遷項目的實施，促進了公司的產業升級、管理升級和服務升級。2011年12月，“云南白藥產業基地落成典禮”成功舉辦，揭開了云南白藥新的發展篇章。云南省委省政府領導親臨現場，對企業10余年的持續、快度發展給予了充分的肯定，鼓勵云南白藥通過“新白藥、大健康”戰略的實施，為云南省生物醫藥經濟的發展探索新的發展路徑，省委、省政府將將一如既往支持、扶持、培育云南白藥。
2016年12月，為全面深化國企改革，推進企業混合所有制改革試點，快速做強、做優、做大云南白藥，云南省國資委、新華都實業集團股份有限公司、云南白藥控股有限公司在昆明舉行了合作協議簽字儀式，擬通過完全增資的形式引入新華都實業集團股份有限公司作為云南白藥控股有限公司的戰略投資人。
2019年，云南白藥集團完成吸收合并云南白藥控股。云南白藥通過發行股份的方式對白藥控股實施吸收合并。云南白藥為吸收合并方，白藥控股為被吸收合并方。本次吸收合并完成后，云南白藥為存續方，將承繼及承接白藥控股的全部資產、負債、合同及其他一切權利與義務，白藥控股將注銷法人資格；白藥控股持有的上市公司股份將被注銷，云南省國資委、新華都及江蘇魚躍將成為上市公司的股東。
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